四川农大最新文章获miRNA研究新发现

    |     2013年11月11日   |   科研   |     1 条评论   

生物通报道:来自四川农业大学动物遗传育种研究所,美国休斯顿大学,LC Sciences公司等处的研究人员发表了题为“Repertoire of Porcine MicroRNAs in Adult Ovary and Testis by Deep Sequencing”的文章,深入研究了microRNA在猪成熟卵巢和睾丸中的表达图谱。这一研究成果公布在International Journal of Biological Sciences杂志上。[O_U user_role=”Administrator,Author,Contributor,Editor,Subscriber,Customer,Shop Manager” blocked_meassage=”请登录后继续浏览“]

文章的通讯作者是四川农业大学李学伟教授,以及美国LC Sciences公司首席科学家,休斯顿大学高晓莲教授,其中李学伟教授早年毕业于四川农学院(现四川农业大学),现任四川农业大学博士生导师、四川省学术和技术带头人,国家“千百万人才工程”百千层次人才,四川省跨世纪青年科技学术带头人,享受国务院特殊津贴。文章第一作者是李明洲博士。

microRNA(miRNA)是一大类短小的内源性RNA,已知它们可以在转录后水平上抑制基因表达,并参与了几乎所有的细胞生理过程。miRNA表达水平的变化与许多疾病密切相关。卵巢卵泡发育与睾丸生精功能是复杂而又协调的生理过程,其中大量基因的严密调节表达和相互作用可能会受到这些miRNA的调控。识别和初步表征生殖腺特异表达的miRNA将是透彻了解由miRNA介导的转录后基因调控在哺乳动物生殖过程中所起作用的先决条件。

在这篇文章中,研究人员利用深度测序技术(Solexa测序),对成熟卵巢和睾丸内的猪miRNA表达谱进行了鉴定,并利用专门开发的生物信息学分析管道对测序数据进行了深入分析。将可信的成熟miRNA同其它种类的小分子RNA进行了区分。通过这种方法,研究人员共检测到582条前体发夹序列(miRNA前体),编码732条成熟miRNA,其中673条为单一序列。统计学分析显示,224条miRNA(占673条的33.28%)在卵巢和睾丸文库之间存在显著差异表达(P < 0.001)。大多数位于X染色体(伴X染色体miRNA)的差异表达miRNA(34条中的24条,占70.59%)在卵巢中的表达较睾丸中显著上调(P < 0.001)。可以预见,伴X染色体miRNA为睾丸优先表达或睾丸特异性表达模式。

为了探究伴X染色体miRNA在基因组定位簇之间共表达的可能性,研究人员采用实时荧光定量PCR(q-PCR)技术,考察了在7种常见猪组织中miRNA位点的间隔距离与32个高置信度伴X染色体miRNA共表达模式之间的关系。实验结果显示,邻近的miRNA对常会共同表达,暗示50kb基因组距离内的miRNA通常来源于共同的转录本。

此项研究以伴X染色体miRNA的共表达模式为研究重点,研究了成年猪生殖腺的miRNA转录组特征。该研究成果将会促进有关miRNA在器官特异性的生殖过程所扮演角色的研究。[/O_U]


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  1. 杨军 2013-11-11 17:28
    恭贺母校