内蒙古农业大学教授呼和巴特尔最近表示，自2000年以来，内蒙古奶牛养殖场的疫病总体上呈上升的趋势。疫病体现在奶牛身上主要是奶牛口蹄疫和五号病。奶牛口蹄疫频繁爆发的状况让我们的奶业发展产生了瓶颈，它一直是制约奶业发展的因素之一，经过调研发现出现这种状况的原因是：
第一、生产疫苗的工艺水平落后。在疫苗生产中对于工艺方面，我们一直没有较大突破，所以疫苗的抗体率低，保护率低，导致奶牛产奶量明显减少，而且有些奶牛没有受到相应保护而容易流产，这样使得养殖户效益低。第二、结核病与布氏杆菌病出现范围大，据有关资料显示：在内蒙古西部部分奶牛养殖场做了1万头奶牛的试验研究结果表明：奶牛布氏杆菌病得病率达到1.8%，这使得奶业在发展过程中受到很大压制，对奶业的危害日趋严重。结核病也不容乐观，在内蒙古西部的部分奶牛场1000多头奶牛调查中发现的病牛比率在1.51%，在其他很多地方已经达到了3%左右。
疫病问题一直以来没有得到很好解决的主要原因是：第一、从奶牛发病到被确诊时间非常长，政府没能马上拨款治理这样的问题，所以才会出现疫病持续扩散的情况。第二、当饲养员发现奶牛有病的时候，牧场就开始卖牛，一旦奶牛被卖出，这些有病的奶牛就会被当做好牛转移到其他地方，这与有关部门没有很快落实屠宰有很大关系。此外，奶牛的乳房炎仍然是居高不下，这与奶牛养殖环境有极大的关系。奶牛乳房炎在散户那里的发病率极其高。
除此以外，抗生素等药物超标使原奶质量大打折扣。
因此，加强内蒙古奶牛养殖安全措施首先要分步实施奶牛疫病的根除计划，保障奶牛安全。现在防治疫病最有效的方法就是继续对奶牛疫病强制控制措施；对布氏杆菌病采取免疫加补差的方法；对结核病采取一旦查出则立即处理的措施。这主要是依靠政府部门要把资金投入到位。但是最根本治理疫病的措施应该是国家及时出台一个疫病根除计划，彻底走出这种恶性循环的局面，除此以外，政府还应该引导散户逐渐推出养牛业，逐渐向规模化、集约化发展。因为散户占据比例较大，而且分散饲养模式不利于国家管理，对于疫病的管理与控制不方便，这样一来国家提出的“养健康牛、产安全奶”的计划实施起来困难会比较多一些，奶业发展也会任重而道远。
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